RMN et Interactions Lipides-Protéines
Les protéines membranaires représentent environ 30 % du protéome et sont des cibles pharmacologiques majeures mais peu de structures tridimensionnelles sont connues ce qui traduit la faiblesse des méthodes d’analyse de tels systèmes. Il en est de même pour l’étude des interactions entre lipides et protéines, y compris pour les protéines membranaires extrinsèques, dont beaucoup se fixent de façon réversible sur la membrane.
Notre équipe a pour objectif de mettre en évidence et de caractériser les interactions de protéines membranaires extrinsèques avec les lipides. La spécificité des interactions selon la nature des lipides et la structure des systèmes employés, ainsi que les modifications structurales engendrées chez les protéines sont déterminées par des approches complémentaires, essentiellement fluorescence, dichroïsme circulaire et RMN.
Les thématiques étudiées actuellement :
- La dystrophine est la protéine dont l’absence est responsable de la myopathie de Duchenne. Dans le cas des myopathies de Becker, des mutations du domaine central sont associées à des phénotypes plus ou moins sévères. L’hypothèse à vérifier est que cette diversité de gravité du phénotype est due à des modifications soit de stabilité ou de conformation des protéines, soit des interactions avec les lipides, ces modifications étant variables selon la nature des mutations de la dystrophine. More about this...
- Les changements structuraux du cytochrome c en association avec des liposomes peuvent être étudiés par la dynamique de dissociation des complexes cytochrome c – lipides en utilisant la RMN paramagnétique. L’objectif sera notamment de travailler avec des fragments de membrane interne mitochondriale pour mimer la situation rencontrée dans la cellule.
- Nous avons récemment démontré que la dynamique d’association et de dissociation de molécules en interaction avec des phospholipides était suffisante pour permettre l’utilisation des petites vésicules unilamellaires (SUV) et de la RMN du proton, dans des conditions de la RMN du liquide. More about this Cette observation ouvre de réelles perspectives intéressantes pour l’analyse structurale de peptides bioactifs en association dynamique avec les membranes. Une collaboration avec M. Baudy-Floc’h (UMR CNRS 6226 équipe IMCV) porte sur la détermination structurale d’hydrazinopeptoïdes biologiquement actifs. More about this...
Collaboration dans le cadre de la plateforme PRISM
L’équipe est aussi responsable de la composante spectroscopie de la plateforme PRISM (Plateforme Rennaise d’Imagerie et Spectroscopie structurale et Métabolique) dont un des objectifs est de proposer aux biologistes de l’IFR 140 et de Ouest génopôle des outils permettant de résoudre la structure tridimensionnelle et de réaliser des études d’interactions impliquant des peptides et de petites protéines.Dans ce cadre, un travail en commun avec Carlos Blanco et Sylvie Bonnassie (équipe DUALS) a été réalisé L’objectif etait de relier la modulation de l’activité enzymatique de la DiHydroFolateRéductase (DHFR), exercée par les osmoprotecteurs, à des variations de la structure ou de la dynamique de l’enzyme. More about this...
Équipements disponibles
- Spectrophotofluorimètre à flux interrompu SFM 300 (BioLogic)
Plateforme Spectroscopie IFR140
- Fluorimètre Fluorolog 3 (Horiba Jobin Yvon)
- Spectropolarimètre pour la mesure du Dichroïsme Circulaire J815 (Jasco)
Plateforme PRISM
- Spectromètre RMN 500 MHz avec sondes HR-MAS et BBO (Bruker)
- Spectromètre RMN 500 MHz avec cryosonde TXI (Bruker)
Venir nous voir
Equipe RMN-ILP (PRISM), UMR CNRS 6026
RdC Batiment 5, campus Villejean.
2 Av du Prof Léon Bernard. Rennes, France.
mis à jour le 26 mars 2008